水保存法是将木材存放在河道、河泊等水流速度低而平缓的区域，或将 原木存放在水池中，使木材表面水分呈饱和状态，可预防干裂，同时也可以防止菌类侵害，因木材含水率高则氧气的含量低，变色菌和腐朽菌难以生存，一 般蛀虫也不易产生。
将原木完全浸泡于水中，是有效的保护方法。此方法在我国前期传统的红木家具生产就已经有使用，通常将木材存放在水中达到数月 之久，待木材表面树皮腐烂、脱落后才进行后续的加工工序。
但如果保管不当或在保管过程中不处理木材的端头和表 面，容易产生开裂等质量问题。为了减少木材在保管过程中的质量损失，还要采取以下措施： 木材端封：由于木材端部的气干速度较快，所有的木材在 储存或干燥过程中都会发生某种程度的端裂。
若在造材或制材之后，立即以特质端部防裂漆将材端涂封，可防止端裂发生。材端涂封多用于高价值的木材以 求经济。比重大的木材较容易发生端裂与劈裂，同时，干裂的程度会随着木材直径的增大而增大。有时需将半干木材的端裂部分切除再涂封。