保函是可以由：担保公司、银行、保险公司出具的，因此，担保公司出具保函是一点问题没有的。
担保公司有好有坏，好的就是国企、上市企业，差点的就是普通的企业，用什么担保机构，得根据招标文件、合同、业主的要求来定，但是还有重要的一点就是，其实这个可以协商，只要你觉得能搞定业主，受益人同意了，就可以用担保公司走过场。
办理担保公司保函的费用，这个每家定的都不一样，投标保函一般在几百块，履约和预付款保函，基本都得在0.3%-3%左右（跨度大是因为根据担保机构不同、保函金额不同、期限不同、格式不同等等综合来决定的），如果您特想了解具体价格，需要提供：招标文件电子版、中标通知书电子版就可以给您报价，如果您只提供个保函金额和时间，给您报价低了，后期可能涨价，您不干，报高了，您可能直接感觉是忽悠您了，不给资料要报价，是不准确的，给到您的也是便宜的，给了资料了就不是那么一回事了，这个只有您经历过一次就知道了，想套路少，就需要给资料。
如果走了招投标程序，投标保函、履约保函、预付款保函等常见的保函，都是投标方开给招标方的，如果没有走招投标手续，施工项目，就是施工方开给业主的，采购供货项目的是收款方开给付款方的，很多人不理解了，我收钱了，我为嘛给他开保函啊，其实这是为了保障付款方这个钱不会打水漂，如果你收了钱，不干活儿或者不提供货物，那么付款方不就麻烦了，如果银行、保险公司或者担保公司给这个企业做担保，如果不干活儿，那就从担保机构要钱，多了一层保障，一般这个担保机构银行居多，毕竟银行在大众的性高，认可度高，大多数企业都信任银行。
总的来说，银行保函利大于弊，下面拆开来讲，保函就是替代保证金，可以替代投标保证金、履约保证金、预付款保证金、质量保证金和农民工工资保证金等等，简单点说，给了业主保函，就不需要给业主交保证金了，这样的好处，可以规避保证金到期后，业主不退或者延迟退还的好处，坏处就是开多大的保函，就要存多少钱到银行冻结，非常的占用公司的资金，如果项目多，光保证金占用也是一个很大的资金缺口，毕竟钱放在项目上不香吗？