水族缸中常出现的藻类有三类：蓝藻、绿藻和黄绿藻。绿藻更是淡水水族缸中常见的藻类，而且种类极多，大多为丝状。其及为耐阴，只要有一点光线即能生存。
虽然有不少去除水藻的方法，但尚无一种完美的方法，仍然是“预防为主，其次，综合运用”的治藻方法。如果您的鱼缸是一只没有栽植大量水草的裸缸，清除藻类的方法就较简单：
1鱼缸不要让阳光直射.
2控制鱼只蜜度，适当减少鱼的数量.
3减少鱼饵的投放量.
4勤换水，但一次换水量不宜过多.
5将附在缸壁上的污垢及时清理掉.
6加强鱼缸的过滤系统，使之更有效率
鱼缸根据制作的工艺可以将其裁减到合适尺寸然后再在边缘的切口上加以磨平以后，除了不会影响到其美观度以外，还不会具有危险性，而在专用的玻璃机床上加工的时候一般的情况下是会用三面的导角状磨制出来。
在定做鱼缸的时候为了防止在鱼缸中注入水以后水压让缸体出现变形而发生渗漏等情况的发生，那么就必须得在边缘的位置上加固，相同的材质玻璃一般的情况下是会在缸体和底部的边缘上使用。
在选择玻璃胶的时候在挑选合理价位以后还得拥有良好的售后服务，在购买的时候一定要认准品牌不然很容易发生破裂的情况发生。
鱼缸里面的水因为大量喂食、排析物和鱼身上的分秘物的产生，会有越来越多的有机物质积累，这些有机质废物会凝聚、附着在缸壁上，而大量的都悬浮在水中或沉于底砂上。由于水温高，有机物会加快腐败，导致混浊度增加，水质变坏，溶氧量明显降低，氨及硝酸盐大量增加，水会变得十分浑浊，鱼在这样的水中生活极易得病，甚到死亡。在鱼缸中建成一个生态过滤系统，进行有效的生态过滤，将有机质分解，就可以减少这些附着物的产生，不仅将水中的固体废物过滤清除，使水体变得十分清澈，水质稳定，还可以有效减少鱼病的发生。
鱼缸里的水会因鱼类的粪便、食物残渣、水草腐叶而受到污染。在人们想象中将水中看得见的悬浮物过滤掉，使水保持清澈透明就已达到目的，其实这仅仅只是过滤的初级功能，我们通常称之为机械过滤。现代的观赏鱼缸过滤应是同时具有机械过滤和生物过滤，有时还需要物理过滤。其中尤为重要的是生物过滤。所谓生物过滤，就是通过附着在滤材上的，将溶解在水中的有害物质分解或转化为无害物质。物理过滤则是利用某些材料特有的吸附功能使水净化。物理过滤只在特殊情况下短时间使用，如为了去除水中的剩余药剂等。